Den största fördelen med GNU/Linux är att det är öppet/fritt och att du således har helt andra möjligheter att lära dig om, få kontroll över och anpassa ditt system (såväl hård- som mjukvara) än vad du någonsinn kan med M$ produkter. Det finns även en stor mängd program, ofta flera olika som utför samma uppgift vilket gör att dina valmöjligheter när du skall anpassa ditt system är stora (valmöjligheterna kan även ses som en nackdel; grafiska gränssnitt utseende och funktion är inte konsekventa, det är inte alltid lätt att veta vilket verktyg/program som är mest lämpligt för en uppgift etc).
Det krävs tid, tålmod och energi för att lära sig behärska GNU/Linux, UNIX etc, vilket kan vara en nackdel om du har begränsad fritid. Denna investering i tid och energi har du möjlighet att få igen många gånger om i form av ökad effektivitet och precision när du senare använder GNU/Linux eller andra UNIX-liknande system.